
15 個值得嘗試的 API 設計工具
“統計功效夠 80 % 嗎?”
“缺失值處理流程寫在哪一頁?”
傳統做法:熬夜翻書、搜文獻、寫腳本、套模板,再被導師打回重改。
2025 新做法:打開瀏覽器,輸入一條 prompt,30 秒 后拿到一份直接可提交的實驗設計 PDF,對照組樣本量、隨機化方案、統計方法甚至經費預算全幫你算好。
背后的功臣,正是今天的主角:DeepSeek R1 —— 一個把“實驗設計”做成 SaaS 的開源推理大模型。
本文將手把手演示如何用它 一鍵生成對照組與統計方法模板,并給出可直接落地的腳本、Prompt 清單和踩坑筆記。讀完你將獲得:
維度 | GPT-4o | Claude 3.5 | DeepSeek R1 |
---|---|---|---|
推理深度 | 8K tokens | 12K tokens | 32K+ tokens |
數學/代碼 | 官方未披露 | 官方未披露 | MATH-500 94.3 % |
開源權重 | ? | ? | ? HuggingFace |
免費 API | 限 3 次/分鐘 | 限 40 次/天 | 1000 次/天(申請鏈接) |
Context Caching | 付費 | 付費 | 免費 4 h |
R1 的核心技術亮點在 GRPO(Group Relative Policy Optimization):
簡單說:它擅長在多方案中自動挑選最優解,恰好就是實驗設計最需要的技能。
deepseek-reasoner
(即 R1)。你是一名資深生物統計學家。請基于下列要素生成實驗設計報告:
- 研究類型:{type}
- 主要終點:{endpoint}
- 預期效應量:{effect_size}
- 顯著性水平 α:0.05
- 檢驗效能 1-β:0.8
- 失訪率:10 %
- 輸出格式:JSON Schema(含對照組樣本量、隨機化方法、統計檢驗、缺失值處理、經費預算)
- 語言:中英雙語
示例 prompt(小鼠腫瘤藥效實驗)
你是一名資深生物統計學家……
研究類型:小鼠皮下移植瘤藥效實驗
主要終點:腫瘤體積 TGI (%)
預期效應量:35 %
R1 返回(節選)
{
"study_design": "Parallel 2-arm",
"control_group": {
"n_per_arm": 18,
"randomization": "stratified block (tumor volume)",
"drug": "vehicle, same volume"
},
"statistical_method": {
"hypothesis": "Two-sided t-test on day 21 TGI",
"power_analysis": "G*Power 3.1.9.7, effect size d=1.12",
"multiple_testing": "None"
},
"missing_data": "Mixed model repeated measures (MMRM)",
"budget": { "mice": 1800 USD, "drug": 1200 USD, "histology": 900 USD }
}
復制 → 粘貼到 Overleaf → 直接生成 PDF,全程 30 秒。
import requests, json, os
API_KEY = os.getenv("DEEPSEEK_API")
url = "https://api.deepseek.com/v1/chat/completions"
payload = {
"model": "deepseek-reasoner",
"messages": [
{"role": "system", "content": "You are a biostatistician..."},
{"role": "user", "content": open("prompt.txt").read()}
],
"response_format": { "type": "json_object" },
"max_tokens": 4000
}
headers = {"Authorization": f"Bearer {API_KEY}"}
resp = requests.post(url, json=payload, headers=headers)
design = json.loads(resp.json()["choices"][0]["message"]["content"])
json.dump(design, open("design.json", "w"), indent=2, ensure_ascii=False)
安裝插件 pandoc-fignos
后,執行:
python render.py design.json template.md # 生成 filled.md
pandoc filled.md -o report.pdf --pdf-engine=xelatex
render.py
完整源碼(可直接保存使用):
#!/usr/bin/env python3
import json, sys, re, os
def load_schema(file):
return json.load(open(file, encoding='utf-8'))
def fill_template(design, tpl):
md = open(tpl, encoding='utf-8').read()
for k, v in design.items():
placeholder = "{{" + k + "}}"
if isinstance(v, (dict, list)):
v = json.dumps(v, ensure_ascii=False, indent=2)
md = md.replace(placeholder, str(v))
return md
if __name__ == "__main__":
design_file, template_file = sys.argv[1], sys.argv[2]
design = load_schema(design_file)
filled = fill_template(design, template_file)
out_file = template_file.replace(".md", "-filled.md")
open(out_file, "w", encoding='utf-8').write(filled)
print("Filled template written to", out_file)
template.md
示例(節選):
# 實驗設計報告
## 1 研究設計
- 類型:{{study_design}}
- 對照組樣本量:{{control_group.n_per_arm}}
## 2 統計方法
- 假設檢驗:{{statistical_method.hypothesis}}
- 功效分析:{{statistical_method.power_analysis}}
library(lme4)
lmer(log(tumor) ~ group * time + (1|mouse) + (1|cage), data=df)
{
"study_design": "Bayesian sequential A/B",
"control_group": { "n_per_arm": 6820 },
"statistical_method": {
"prior": "Beta(1,1)",
"stopping_rule": "Posterior prob > 0.95",
"expected_duration": "14 days"
}
}
{
"study_design": "Cross-sectional 3-stage stratified PPS",
"control_group": { "n_per_arm": 392 },
"statistical_method": {
"weight": "raking on age/sex/region",
"analysis": "svyglm with survey package"
}
}
場景 | Prompt 片段 |
---|---|
動物藥效 | 研究類型:小鼠皮下移植瘤藥效實驗;主要終點:TGI;效應量:35 % |
動物毒理 | 研究類型:大鼠 28 天重復給藥毒性;主要終點:NOAEL;效應量: > 2 倍安全窗口 |
臨床 I 期 | 研究類型:first-in-human dose escalation;主要終點:DLT;設計:3+3 |
臨床 II 期 | 研究類型:單臂 Simon 二階段;主要終點:ORR;預期 45 % vs 25 % |
臨床 III 期 | 研究類型:雙臂優效;主要終點:PFS;HR=0.75;中期分析:O’Brien–Fleming |
診斷試驗 | 研究類型:前瞻性診斷;主要終點:AUC;預期 AUC=0.85 vs 0.7 |
真實世界研究 | 研究類型:回顧性隊列;主要終點:OS;混雜控制:PSM+IPTW |
A/B 測試 | 研究類型:互聯網 A/B;主要終點:CTR;相對提升:8 % |
社會調查 | 研究類型:橫斷面問卷;主要終點:PHQ-9;效應量:d=0.2 |
教育干預 | 研究類型:整群隨機對照;主要終點:考試成績;ICC=0.05 |
問題 | 原因 | 解決 |
---|---|---|
樣本量過大 | 效應量估計過保守 | 用先驗分布輸入:effect_size_prior: N(0.4, 0.1) |
R1 拒絕回答 | 涉及倫理/暴力 | system prompt 加 “Assume IACUC approved” |
JSON 格式報錯 | 引號未轉義 | 設置 response_format: json_object |
中文輸出亂碼 | 終端編碼問題 | 設置 PYTHONIOENCODING=utf-8 |
API 報錯 429 | 并發過高 | 加 time.sleep(1) 或申請付費額度 |
DeepSeek 官方透露,R2 將集成 Code Interpreter,預計 2025 Q4 發布。屆時可直接:
.csv
→ 自動清洗 → 輸出 Protocol + SAP(Statistical Analysis Plan) 從 1990 年的 GraphPad 到 2025 年的 DeepSeek R1,工具迭代的目標始終是讓科學家回歸科學本身。
當你可以用一杯咖啡的時間完成原本三周的方案撰寫,你就擁有了更多精力去思考:
工具只是杠桿,問題才是支點。
現在就打開 DeepSeek Playground,用本文的 Prompt 生成你的第一份自動化實驗設計吧!