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生物醫(yī)學和生命科學檔案庫-PubMed
專用API
【更新時間: 2024.06.26】
"學術(shù)文字查找服務-PubMed" 是由美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)提供的生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫服務。PubMed 包含了數(shù)百萬篇生物醫(yī)學領(lǐng)域的期刊文章、書籍章節(jié)、會議論文等,涵蓋了醫(yī)學、護理學、獸醫(yī)學、健康科...
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什么是PubMed的生物醫(yī)學和生命科學檔案庫?
PubMed Central(PMC)是由美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)維護和運營的一個免費開放存取數(shù)據(jù)庫,專注于提供生物醫(yī)學和生命科學領(lǐng)域的全文文獻。PMC的目標是為全球研究人員、醫(yī)療專業(yè)人士和公眾提供方便的文獻獲取途徑,促進科學知識的傳播和共享。該平臺收錄了來自多種期刊的文章、學術(shù)論文和會議記錄,致力于支持生物醫(yī)學研究、教育和臨床實踐。
什么是PubMed的生物醫(yī)學和生命科學檔案庫接口?
PubMed的生物醫(yī)學和生命科學檔案庫有哪些核心功能?
- 全文訪問:提供數(shù)百萬篇生物醫(yī)學和生命科學文獻的免費全文訪問。
- 文獻檢索:通過強大的搜索引擎和檢索功能,用戶可以快速找到相關(guān)文獻。
- 數(shù)據(jù)導出:支持文獻數(shù)據(jù)的導出和下載,便于離線閱讀和研究。
- 期刊瀏覽:按期刊、專題和出版日期瀏覽文獻,輕松獲取最新研究成果。
- 關(guān)聯(lián)資源:與PubMed數(shù)據(jù)庫和其他NCBI資源集成,提供全面的文獻和數(shù)據(jù)支持。
PubMed的生物醫(yī)學和生命科學檔案庫的技術(shù)原理是什么?
PubMed的生物醫(yī)學和生命科學檔案庫的核心優(yōu)勢是什么?
- 免費開放:所有文獻均可免費訪問,消除了獲取科學知識的經(jīng)濟障礙。
- 數(shù)據(jù)豐富:涵蓋廣泛的生物醫(yī)學和生命科學領(lǐng)域,提供豐富的文獻資源。
- 高質(zhì)量:由權(quán)威機構(gòu)維護,確保數(shù)據(jù)的準確性和可信度。
- 多樣性:包含期刊文章、學術(shù)論文和會議記錄等多種文獻類型。
- 全球覆蓋:支持多語言檢索和訪問,服務全球用戶。
在哪些場景會用到PubMed的生物醫(yī)學和生命科學檔案庫?
- 文獻檢索應用:開發(fā)人員可以使用 PubMed API 構(gòu)建自己的文獻檢索應用,為用戶提供更加便捷、個性化的文獻搜索服務。
- 科研數(shù)據(jù)分析:研究人員可以利用 PubMed API 獲取大量的生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù),進行數(shù)據(jù)挖掘、文本分析等科研數(shù)據(jù)分析工作。
- 學術(shù)出版平臺:學術(shù)出版平臺可以利用 PubMed API 對出版物進行引用驗證、文獻檢索等工作,提高出版物的質(zhì)量和影響力。
- 在線教育平臺:在線教育平臺可以利用 PubMed API 為學生提供生物醫(yī)學領(lǐng)域的在線學習資源,幫助學生更好地理解和掌握相關(guān)知識。


使用電子實用程序 URL
所有電子實用程序請求都應發(fā)送至以以下字符串開頭的 URL:
https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/
這些 URL 將請求直接發(fā)送到僅由電子實用程序使用的服務器,這些服務器經(jīng)過優(yōu)化,可以為用戶提供最佳性能。
電子實用程序 URL 請求的頻率、時間和注冊
為了不使 E-utility 服務器過載,NCBI 建議用戶每秒發(fā)布的 URL 請求不超過三個,并將大型作業(yè)限制在周末或工作日東部時間晚上 9:00 至凌晨 5:00 之間。不遵守此政策可能會導致 IP 地址被阻止訪問 NCBI。如果 NCBI 阻止了 IP 地址,除非訪問 E-utilities 的軟件開發(fā)人員向 NCBI 注冊工具和電子郵件參數(shù)的值,否則服務將無法恢復。工具的值應為沒有內(nèi)部空格的字符串,可唯一標識生成請求的軟件。電子郵件的值應為軟件開發(fā)人員的完整有效電子郵件地址,而不是第三方最終用戶的電子郵件地址。如果 NCBI 發(fā)現(xiàn)違反我們政策的請求,電子郵件的值將僅用于聯(lián)系開發(fā)人員,我們將在阻止訪問之前嘗試進行此類聯(lián)系。此外,開發(fā)人員可以請求將電子郵件的值添加到 E-utility 郵件列表中,該列表提供軟件更新、已知錯誤和其他影響 E-utilities 的政策變更公告。要注冊工具和電子郵件值,只需向vog.hin.mln.ibcn@seitilitue發(fā)送電子郵件,包括所需值以及開發(fā)人員或創(chuàng)建軟件的組織的名稱。一旦 NCBI 與開發(fā)人員建立聯(lián)系,收到工具和電子郵件的值并驗證電子郵件中的電子郵件地址,就會解除封鎖。一旦注冊了工具和電子郵件值,該軟件包的所有后續(xù) E-utility 請求都應包含這兩個值。請注意,僅在請求中提供工具和電子郵件的值不足以遵守此政策;這些值必須在 NCBI 注冊。任何 IP 的請求如果缺少工具和電子郵件的注冊值并且違反上述使用政策,都可能被阻止。軟件開發(fā)人員可以隨時注冊工具和電子郵件的值,并鼓勵他們這樣做。
API 密鑰
自 2018 年 12 月 1 日起,NCBI 提供了 API 密鑰,以提供對 E-utilities 的增強支持訪問級別。如果沒有 API 密鑰,任何向 E-utilities 每秒發(fā)布超過 3 個請求的站點(IP 地址)都會收到錯誤消息。通過包含 API 密鑰,站點默認每秒最多可以發(fā)布 10 個請求。更高的速率可通過請求獲得(vog.hin.mln.ibcn@seitilitue)。用戶現(xiàn)在可以從其 NCBI 帳戶的“設(shè)置”頁面獲取 API 密鑰(要創(chuàng)建帳戶,請訪問http://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/ )。創(chuàng)建密鑰后,用戶應將其分配給api_key參數(shù),將其包含在每個 E-utility 請求中。
詳細指南鏈接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/develop/https-guidance/




PubMed Central ® (PMC) 是美國國立衛(wèi)生研究院國家醫(yī)學圖書館 (NIH/NLM) 的免費全文生物醫(yī)學和生命科學期刊文獻檔案。根據(jù) NLM 收集和保存生物醫(yī)學文獻的立法要求,PMC 是 NLM 收藏的一部分,其中還包括 NLM 的大量印刷版和授權(quán)電子期刊藏品,并支持當代生物醫(yī)學和醫(yī)療保健研究和實踐以及未來的學術(shù)研究。
PMC 自 2000 年起在線向公眾開放,由 NLM 的國家生物技術(shù)信息中心 (NCBI) 開發(fā)并維護。
PMC 自 2000 年成立以來,從僅包含兩本期刊(PNAS:美國國家科學院院刊和細胞分子生物學)發(fā)展成為包含數(shù)千種期刊文章的檔案庫。此外,PMC 還包含通過NIH 手稿提交系統(tǒng)(NIHMS) 存放的作者手稿,以及通過NIH 預印本試點收集的預印本。


使用電子實用程序 URL
所有電子實用程序請求都應發(fā)送至以以下字符串開頭的 URL:
https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/
這些 URL 將請求直接發(fā)送到僅由電子實用程序使用的服務器,這些服務器經(jīng)過優(yōu)化,可以為用戶提供最佳性能。
電子實用程序 URL 請求的頻率、時間和注冊
為了不使 E-utility 服務器過載,NCBI 建議用戶每秒發(fā)布的 URL 請求不超過三個,并將大型作業(yè)限制在周末或工作日東部時間晚上 9:00 至凌晨 5:00 之間。不遵守此政策可能會導致 IP 地址被阻止訪問 NCBI。如果 NCBI 阻止了 IP 地址,除非訪問 E-utilities 的軟件開發(fā)人員向 NCBI 注冊工具和電子郵件參數(shù)的值,否則服務將無法恢復。工具的值應為沒有內(nèi)部空格的字符串,可唯一標識生成請求的軟件。電子郵件的值應為軟件開發(fā)人員的完整有效電子郵件地址,而不是第三方最終用戶的電子郵件地址。如果 NCBI 發(fā)現(xiàn)違反我們政策的請求,電子郵件的值將僅用于聯(lián)系開發(fā)人員,我們將在阻止訪問之前嘗試進行此類聯(lián)系。此外,開發(fā)人員可以請求將電子郵件的值添加到 E-utility 郵件列表中,該列表提供軟件更新、已知錯誤和其他影響 E-utilities 的政策變更公告。要注冊工具和電子郵件值,只需向vog.hin.mln.ibcn@seitilitue發(fā)送電子郵件,包括所需值以及開發(fā)人員或創(chuàng)建軟件的組織的名稱。一旦 NCBI 與開發(fā)人員建立聯(lián)系,收到工具和電子郵件的值并驗證電子郵件中的電子郵件地址,就會解除封鎖。一旦注冊了工具和電子郵件值,該軟件包的所有后續(xù) E-utility 請求都應包含這兩個值。請注意,僅在請求中提供工具和電子郵件的值不足以遵守此政策;這些值必須在 NCBI 注冊。任何 IP 的請求如果缺少工具和電子郵件的注冊值并且違反上述使用政策,都可能被阻止。軟件開發(fā)人員可以隨時注冊工具和電子郵件的值,并鼓勵他們這樣做。
API 密鑰
自 2018 年 12 月 1 日起,NCBI 提供了 API 密鑰,以提供對 E-utilities 的增強支持訪問級別。如果沒有 API 密鑰,任何向 E-utilities 每秒發(fā)布超過 3 個請求的站點(IP 地址)都會收到錯誤消息。通過包含 API 密鑰,站點默認每秒最多可以發(fā)布 10 個請求。更高的速率可通過請求獲得(vog.hin.mln.ibcn@seitilitue)。用戶現(xiàn)在可以從其 NCBI 帳戶的“設(shè)置”頁面獲取 API 密鑰(要創(chuàng)建帳戶,請訪問http://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/ )。創(chuàng)建密鑰后,用戶應將其分配給api_key參數(shù),將其包含在每個 E-utility 請求中。
詳細指南鏈接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/home/develop/https-guidance/






PubMed Central ® (PMC) 是美國國立衛(wèi)生研究院國家醫(yī)學圖書館 (NIH/NLM) 的免費全文生物醫(yī)學和生命科學期刊文獻檔案。根據(jù) NLM 收集和保存生物醫(yī)學文獻的立法要求,PMC 是 NLM 收藏的一部分,其中還包括 NLM 的大量印刷版和授權(quán)電子期刊藏品,并支持當代生物醫(yī)學和醫(yī)療保健研究和實踐以及未來的學術(shù)研究。
PMC 自 2000 年起在線向公眾開放,由 NLM 的國家生物技術(shù)信息中心 (NCBI) 開發(fā)并維護。
PMC 自 2000 年成立以來,從僅包含兩本期刊(PNAS:美國國家科學院院刊和細胞分子生物學)發(fā)展成為包含數(shù)千種期刊文章的檔案庫。此外,PMC 還包含通過NIH 手稿提交系統(tǒng)(NIHMS) 存放的作者手稿,以及通過NIH 預印本試點收集的預印本。